بررسی میزان مشارکت ژن های دخیل در سرطان سلول های استرومای سینه بر اساس تجزیه و تحلیل نتایج ریزآرایه با استفاده از مدل ریاضی

نویسندگان

هادی آقایاری

hadi aghayari ، دکتر مجید حسن پورعزتی

majid hassanpuor-ezatti shahed university, opposite of holy shrine of imam khomeini, khalij fars expressway, tehran, zip code: 33129118651; iran; p.o.box: 18155/159;تهران، اتوبان خلیج فارس، روبروی حرم مطهر حضرت امام خمینی (ره)، دانشگاه شاهد، دکتر حمیدرضا نویدی

hamid reza navidi سعید برجسته

said barjesteh

چکیده

سابقه و هدف: سرطان سینه شایعترین نوع سرطان و عمده ترین دلیل مرگ ناشی از سرطان در زنان سراسر دنیا است. تعیین عوامل مؤثر در این بیماری یکی از دغدغه های جامعه پزشکی امروز است. عوامل ژنتیکی یکی از مؤثرترین عوامل در بروز سرطان سینه هستند. برخی گزارشات پزشکی به طور انتزاعی به نقش برخی از ژن ها در این بیماری اشاره کرده اند. در این پژوهش با توجه به عدم وجود اطلاعات کافی و معتبر برای مدل سازی ریاضی درباره بیان ژن های شناخته شده در این نوع سرطان، اطلاعات مورد نیاز برای مدل سازی درباره تغییرات بیان ژنی از سایت ncbi جمع آوری گردید. مواد و روشها: این پژوهش به روش توصیفی روی مجموعه داده های بیان ژنی حاصل از تجزیه و تحلیل ریزآرایه مربوط به 5 فرد سالم و 28 بیمار مبتلا به سرطان سلول های استرومای سینه موجود در سایت ncbi صورت گرفت. مدل سازی بر روی بیان 22277 ژن مرتبط با این نوع سرطان صورت گرفت. در این مدل، هر ژن به عنوان یک بازیکن در بازی tu در نظر گرفته شد و سهم مشارکت هر یک از ژن ها در این نوع سرطان محاسبه گردید. سرانجام 200 ژن که سهم بیشتری داشتند انتخاب و رتبه بندی شدند. یافته ها: نتایج این پژوهش دال بر این هستند که بیش از 200 ژن سهم مشارکتی بالایی در بروز این نوع سرطان دارند، اما تغییر در بیان ژن های ddr1، slc23a2 و padi2 به ترتیب بالاترین سهم مشارکت در بروز سرطان در سلول های استرومای سینه را در مقایسه با دیگر ژن ها در این نوع سرطان دارا می باشند. نتیجه گیری: به نظر می رسد که تغییر در بیان تعدادی از ژن ها در این نوع سرطان به وقوع می پیوندد. در تأیید یافته ما، نقش تغییر در بیان ژن های ddr1 و padi2 در بروز این نوع سرطان به طور تجربی در پژوهشهای قبلی نشان داده شده است. اما این پژوهش از نظر رتبه بندی بیان ژن هایی که در سرطان سینه دچار تغییر می شوند، منحصر به فرد است. این رتبه بندی بیان ژنی دارای ارزش پشتیبانی بالایی در تصمیم گیری برای تشخیص و درمان سرطان است. تصمیم گیری نهایی در ارتباط با صحت طبقه بندی ما منوط به نتایج پژوهشهای تحلیلی در ارتباط با تعیین سهم ژن های دخیل در بروز سرطان سینه است.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

بررسی میزان مشارکت ژن‌های دخیل در سرطان سلول‌های استرومای سینه بر اساس تجزیه و تحلیل نتایج ریزآرایه با استفاده از مدل ریاضی

سابقه و هدف: سرطان سینه شایعترین نوع سرطان و عمده‌ترین دلیل مرگ‌ ناشی از سرطان در زنان سراسر دنیا است. تعیین عوامل مؤثر در این بیماری یکی از دغدغه‌های جامعه پزشکی امروز است. عوامل ژنتیکی یکی از مؤثرترین عوامل در بروز سرطان سینه هستند. برخی گزارشات پزشکی به طور انتزاعی به نقش برخی از ژن‌ها در این بیماری اشاره کرده‌اند. در این پژوهش با توجه به عدم وجود اطلاعات کافی و معتبر برای مدل‌سازی ریاضی درب...

متن کامل

تحلیل تصاویر ریزآرایه به منظور تشخیص نوع سرطان سینه

Background: Microarray technology is a powerful tool to study and analyze the behavior of thousands of genes simultaneously. Images of microarray have an important role in the detection and treatment of diseases. The aim of this study is to provide an automatic method for the extraction and analysis of microarray images to detect cancerous diseases. Methods: The proposed system consists of t...

متن کامل

تحلیل تصاویر ریزآرایه به منظور تشخیص نوع سرطان سینه

Background: Microarray technology is a powerful tool to study and analyze the behavior of thousands of genes simultaneously. Images of microarray have an important role in the detection and treatment of diseases. The aim of this study is to provide an automatic method for the extraction and analysis of microarray images to detect cancerous diseases. Methods: The proposed system consists of t...

متن کامل

بررسی فعالیت تلومراز و میزان بیان ژن htert در سلول های سرطان سینه تحت تیمار پاپاورین

زمینه و هدف: حفظ تلومر که برای پایداری کروموزوم و نا میرایی سلول های سرطانی لازم است، بر عهده آنزیمی به نام تلومراز است. بنابراین مهار این آنزیم که در سلول های سوماتیک طبیعی در مقایسه با سلول های سرطانی فعالیت بسیار محدودی دارد، یک روش درمانی ا میدوارکننده محسوب می شود. در یک بررسی اولیه غربالگری متابولیت های ثانوی گیاهی بر رشد سلول های سرطانی پاپاورین از دسته آلکالوئیدهای بنزیل ایزوکوئینولین ا...

متن کامل

پیش بینی اهداف micrornaهای دخیل در سرطان سینه با استفاده از روش های بیوانفورماتیکی

مقدمه: پیش بینی اهداف mirna ها از اهمیت ویژه ای برخوردار است. توسعه روش های محاسباتی و متعاقباً صرفه جویی در هزینه و زمان پژوهش های آزمایشگاهی، تأثیر به سزایی در افزایش سرعت ساخت داروهای درمانی از جمله داروهای ضد سرطانی دارد. با توجه به این که زمان کمی از شناخت mirna ها می گذرد، روند پژوهش ها در ابتدا کند بود. اما به مرور با شکل گیری دیتابیس های بیولوژیکی و درک اهمیت آن ها، دانشمندان بر روی این ...

متن کامل

مقایسه تأثیر وضعیت طاق باز و دمر بر وضعیت تنفسی نوزادان نارس مبتلا به سندرم دیسترس تنفسی حاد تحت درمان با پروتکل Insure

کچ ی هد پ ی ش مز ی هن ه و فد : ساسا د مردنس رد نامرد ي سفنت سرتس ي ظنت نادازون داح ي سکا لدابت م ي و نژ د ي سکا ي د هدوب نبرک تسا طسوت هک کبس اـه ي ناـمرد ي فلتخم ي هلمجزا لکتورپ INSURE ماجنا م ي دوش ا اذل . ي هعلاطم ن فدهاب اقم ي هس عضو ي ت اه ي ندب ي عضو رب رمد و زاب قاط ي سفنت ت ي هـب لاتـبم سراـن نادازون ردنس د م ي سفنت سرتس ي لکتورپ اب نامرد تحت داح INSURE ماجنا درگ ...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
پژوهنده

جلد ۱۷، شماره ۵، صفحات ۲۲۸-۲۳۳

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023